Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYTH1Q15438 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYTH1Q15438 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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