Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUM3Q15397 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
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