Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPNMBQ14956 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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