Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL9A2Q14055 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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