Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDK13Q14004 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDK13Q14004 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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