Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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