Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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