Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ALKBH1Q13686 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms