Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PKD2Q13563 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PKD2Q13563 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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