Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAMK2DQ13557 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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