Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C1orf61Q13536 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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