Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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