Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP2Q13309 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SKP2Q13309 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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