Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
NR1H3Q13133 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NR1H3Q13133 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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