Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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TRAF1Q13077 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
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TRAF1Q13077 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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TRAF1Q13077 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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TRAF1Q13077 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF1Q13077 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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