Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDC16Q13042 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CDC16Q13042 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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