Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTP4A2Q12974 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTP4A2Q12974 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTP4A2Q12974 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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