Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LMAN2Q12907 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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