Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
GRIN2AQ12879 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
GRIN2AQ12879 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
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