Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CHD3Q12873 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHD3Q12873 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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