Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIAQ12857 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIAQ12857 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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