Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GTF3C1Q12789 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GTF3C1Q12789 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GTF3C1Q12789 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GTF3C1Q12789 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C1Q12789 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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GTF3C1Q12789 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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