Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SREBF2Q12772 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SREBF2Q12772 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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