Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX8Q06710 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms