Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms