Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNB3Q05901 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms