Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP7AQ04656 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7AQ04656 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms