Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms