Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREMQ03060 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CREMQ03060 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CREMQ03060 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CREMQ03060 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CREMQ03060 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms