Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 XCL2-201ENST00000367819 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACNB1Q02641 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms