Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAP1Q01518 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAP1Q01518 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms