Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MAT1AQ00266 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms