Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXO4P98177 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXO4P98177 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms