Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPS9P82933 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms