Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB1P82279 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB1P82279 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB1P82279 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB1P82279 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms