Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCCD1P59942 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms