Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL3P58872 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL3P58872 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms