Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CABP4P57796 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CABP4P57796 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABP4P57796 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CABP4P57796 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CABP4P57796 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms