Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJA9P57773 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJA9P57773 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJA9P57773 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA9P57773 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA9P57773 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms