Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BACE1P56817 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BACE1P56817 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE1P56817 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE1P56817 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE1P56817 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE1P56817 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BACE1P56817 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms