Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ELLP55199 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ELLP55199 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ELLP55199 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELLP55199 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms