Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E1P51965 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E1P51965 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms