Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SMARCA2P51531 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SMARCA2P51531 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SMARCA2P51531 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms