Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DAP3P51398 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DAP3P51398 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DAP3P51398 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms