Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ETV1P50549 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ETV1P50549 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ETV1P50549 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ETV1P50549 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ETV1P50549 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms