Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GSK3BP49841 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms