Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP4P49662 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP4P49662 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP4P49662 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP4P49662 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP4P49662 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP4P49662 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms