Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK8P49336 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK8P49336 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK8P49336 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK8P49336 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms