Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLCP48506 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCLCP48506 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLCP48506 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLCP48506 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms