Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA4P48058 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA4P48058 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms